В общем я сканировал картинку (чёрный рисунок на белом фоне) с помощью сканера, затем фотку закидывал в фотошоп, там белый фон делал прозрачным, т.е. альфой, и сохранял всё это в gif. GIF не сохранялся с альфой.
А проблема оказалась в том, что я при сканировании ставил в настройках метод сканирования чёрнобелый, а нужно цветной. При чёрнобелом файл сохраняется только с серым каналом, а при цветном - с тремя каналами (красный, зелёный, синий). А гифу как раз и надо три канала и + альфа!